1865 m. Kovo mėn. Jungtinių Valstijų metu pilietinio karo metu penki šiaurės pašvaistininkai pabėgo iš oro baliono iš pietų Ričmondo. Baisi audra keturis iš jų išmetė į negyvenamos salos pietiniame pusrutulyje krantą. Penktas vyras ir jo šuo slepiasi jūroje prie kranto. Šis penktasis - tam tikras Cyresas Smithas, talentingas inžinierius ir mokslininkas, keliautojų būrio siela ir vadovas - nevalingai kelias dienas laiko įtampoje savo kompanionus, kurie niekur neranda nei jo, nei jam atsidavusio šuns. Labiausiai kenčia buvęs vergas, o dabar Smithui ištikimas tarnas yra Negro Nabas. Balione taip pat buvo karo žurnalistas ir Smitho draugas Gideonas Spiletas, labai energingas ir ryžtingas, sielvartaujantis protas; buriuotojas Pencrofas, geraširdis ir drąsus drąsuolis; Penkiolikmetis Harbertas Brownas, laivo, kuriuo plaukė „Pencrof“, kapitonas, liko našlaičiu ir kurį jūreivis laiko savo sūnumi. Po varginančių paieškų, Nabas pagaliau suranda savo nepaaiškinamai išgelbėtą šeimininką - mylią nuo kranto. Kiekvienas iš naujų salos naujakurių turi nepakeičiamų talentų, o vadovaujant „Cyres“ ir „Spilet“ šie drąsūs žmonės susirenka ir tampa vieninga komanda. Pirmiausia, pasitelkę pačias paprasčiausias priemones, tada savo mažose gamyklose gamindami vis sudėtingesnius darbo ir namų apyvokos daiktus, naujakuriai aprūpina savo gyvenimus. Jie medžioja, renka valgomus augalus, austrius, o vėliau net veisia naminius gyvūnus ir užsiima žemdirbyste. Jie pasirūpina būstu sau aukštai uoloje, oloje, išlaisvintoje nuo vandens. Netrukus dėl sunkaus darbo ir intelekto kolonistai nebežino maisto, drabužių, šilumos ir jaukumo poreikio. Jie turi viską, išskyrus tėvynės naujienas, kurių likimas labai jaudinasi.
Kartą grįžę į savo būstą, kurį vadina Granito rūmais, jie mato, kad viduje beždžionės veržiasi į viršų. Po kurio laiko, tarsi beprotiškos baimės įtakoje, beždžionės pradeda iššokti iš langų, o kieno nors ranka numeta virvių kopėčias, kurias beždžionės iškėlė į namą. Viduje žmonės randa kitą beždžionę - orangutaną, kurį jie laiko ir vadina dėdė Jupe. Ateityje Jupe taps draugu, tarnu ir nepakeičiamu žmonių pagalbininku.
Kitą dieną naujakuriai smėlyje randa dėžę su įrankiais, šaunamaisiais ginklais, įvairiais prietaisais, drabužiais, virtuvės reikmenimis ir knygomis anglų kalba. Gyventojai susimąsto, iš kur galėjo atsirasti ši dėžutė. Iš žemėlapio, kuris taip pat pasirodė langelyje, jie sužino, kad šalia jų salos, žemėlapyje nepažymėta, yra Taboro sala. Jūreivis Pencrofas noriai eina pas jį. Padedamas draugų, jis pastato robotą. Kai botas yra paruoštas, visi kartu eina bandomojo reiso po salą metu. Jos metu jie randa butelį su užrašu, kuriame sakoma, kad sudužusio vyro laukia išgelbėjimas Taboro saloje. Šis įvykis sustiprina Pencroff pasitikėjimą aplankant kaimyninę salą. „Pencrof“, žurnalistai Gideonas Spiletas ir Harbertas išskrido. Atvykę į „Tabor“ jie aptinka nedidelį būrį, kuriame pagal visus požymius niekas seniai negyvena. Jie išsibarstę po salą, nesitikėdami pamatyti gyvo žmogaus, bando surasti bent jo palaikus. Staiga jie išgirsta Harberto riksmą ir skuba į pagalbą. Jie mato Harbertą kovojantį su kažkokiu beždžionių užaugintu padaru. Tačiau beždžionė pasirodo laukinis žmogus. Keliautojai jį suriša ir gabena į savo salą. Jie suteikia jam atskirą kambarį Granito rūmuose. Dėka jų dėmesio ir rūpesčių, žvėris netrukus vėl tampa civilizuotu žmogumi ir papasakoja jiems savo istoriją. Pasirodo, jo vardas Ayrtonas, jis yra buvęs nusikaltėlis, jis norėjo pasisavinti burlaivį „Duncan“ ir pasitelkęs tas pačias visuomenės dregas pavertė piratų laivu. Tačiau jo planams nebuvo lemta išsipildyti ir kaip bausmė prieš dvylika metų jis buvo paliktas negyvenamoje Taboro saloje, kad jis suprastų savo poelgį ir atleistų už savo nuodėmę. Tačiau „Duncan“ savininkas Eduardas Glenarvanas teigė, kad kažkada grįš už Ayrtono. Gyventojai mato, kad Ayrtonas nuoširdžiai gailisi dėl savo praeities nuodėmių, ir jis visais būdais stengiasi būti jiems naudingas. Todėl jie nėra linkę teisti jo dėl praeities netinkamo elgesio ir noriai priima jį į savo visuomenę. Vis dėlto Ayrtonui reikia laiko, todėl jis prašo galimybės pagyventi korale, kurį naujakuriai pastatė savo naminiams gyvūnams per atstumą nuo Granito rūmų.
Naktį, kai robotas grįžo į audrą iš Taboro salos, jį išgelbėjo laužas, kurį, kaip jie manė, plūduriuojantį jį užsidegė jų draugai. Tačiau paaiškėja, kad jie to nedalyvavo. Taip pat paaiškėja, kad Ayrtonas nemetė raštelio butelio į jūrą. Gyventojai negali paaiškinti šių paslaptingų įvykių. Jie vis labiau linkę į mintį, kad, be jų, Linkolno saloje, kai jie jį krikštijo, yra kažkas kitas, jų paslaptingasis geradaris, kuris dažnai ateina jiems į pagalbą sunkiausiose situacijose. Jie netgi pradeda paieškos ekspediciją tikėdamiesi surasti jo gyvenamąją vietą. Tačiau paieškos baigiasi veltui.
Kitą vasarą (nuo tada, kai Ayrtonas pasirodė jų saloje ir dar nepasakydamas jiems savo istorijos, jau praėjo penki mėnesiai ir vasara jau baigėsi, o šaltuoju metų laiku plaukti pavojinga), jie nusprendžia grįžti į Taboro salos, kad trobelėje paliktų užrašą. Pastaboje jie ketina įspėti kapitoną Glenarvaną, jei jis grįš, kad Ayrtonas ir dar penkios katastrofos aukos laukia pagalbos kaimyninėje saloje.
Gyventojai saloje gyvena jau trejus metus. Jų gyvenimas, ekonomika pasiekė klestėjimą. Jie jau renka turtingus kviečių pasėlius, išaugintus iš vieno grūdo, kuris prieš trejus metus buvo rastas Harberto kišenėje, pastatė malūną, augino naminius paukščius, visiškai įrengė savo būstą, iš mufloninės vilnos pasigamino sau naujus šiltus drabužius ir antklodes. Tačiau taikų jų gyvenimą užgožia vienas įvykis, grasinantis jiems mirtimi. Kartą, žvelgdami į jūrą, jie tolumoje mato gerai įrengtą laivą, tačiau virš laivo plaukia juoda vėliava. Laivas inkaras krante. Tai rodo gražius tolimojo ginklo ginklus. Ayrtonas naktį prisidengia laivu, kad galėtų atlikti žvalgybą. Pasirodo, laive yra penkiasdešimt piratų. Stebuklingai paslydęs nuo jų, Ayrtonas grįžta į krantą ir sako savo draugams, kad jiems reikia pasiruošti mūšiui. Kitą rytą iš valties nusileidžia dvi valtys. Pirmajame, naujakuriai šaudo tris, o ji grįžta, antroji nusileidžia paplūdimyje, o šeši likę piratai pasislėpė miške. Patrankos buvo išdegintos iš laivo, ir jis dar labiau priartėjo prie kranto. Panašu, kad niekas neturi galios išgelbėti saujelės naujakurių. Staiga po laivu kyla didžiulė banga ir ji nuskendo. Visi piratai miršta. Kaip vėliau paaiškėja, laivą susprogdino kasykla, ir šis įvykis pagaliau įtikino salos gyventojus, kad jie čia ne vieni.
Iš pradžių jie nesiruošia naikinti piratų, norėdami suteikti jiems galimybę gyventi taikų gyvenimą. Bet pasirodo, plėšikai to nesugeba. Jie pradeda plėšti ir deginti naujakurių namų ūkius. Ayrtonas eina į koralą aplankyti gyvūnų. Piratai sugriebia jį ir nuneša į olą, kur nori kankinti, kad sutiktų kankintis. Ayrtonas nepasiduoda. Jo draugai eina į pagalbą, tačiau yra sunkiai sužeisti Harberto korale, o jo draugai lieka jame, negalėdami grįžti su mirštančiu jaunuoliu. Po kelių dienų jie vis tiek išvyksta į Granito rūmus. Dėl perėjimo Harbertui prasideda piktybinis karščiavimas, jis miršta. Apvaizda vėl įsiterpia į jų gyvenimą ir gero paslaptingo draugo ranka išmeta jiems reikalingus vaistus. Harbertas visiškai pasveiksta. Naujakuriai ketina pateikti paskutinį smūgį piratams. Jie eina į koralą, kur ketina juos surasti, tačiau susiranda išsekusią ir vos gyvą Ayrtoną, o šalia - plėšikų lavonus. Ayrtonas praneša, kad nežino, kaip jis atsidūrė korale, kuris jį išvedė iš urvo ir nužudė piratus. Tačiau jis praneša vieną liūdną naujieną. Prieš savaitę banditai išplaukė į jūrą, tačiau nežinodami, kaip valdyti robotą, sudaužė jį ant pakrančių rifų. Kelionė į „Tabor“ turi būti atidėta, kol bus pastatyta nauja transporto priemonė. Per kitus septynis mėnesius paslaptingasis nepažįstamasis nepadarė savo jausmo. Tuo tarpu saloje atsibunda ugnikalnis, kuris, kolonistų manymu, jau buvo miręs. Jie stato naują didelį laivą, kuris prireikus galėtų juos nugabenti į apgyvendintą žemę.
Vieną vakarą, jau ruošdamiesi miegoti, Granito rūmų gyventojai girdi varpelį. Telegrafas, kurį jie praleido nuo koralų iki savo namų, veikia. Jie skubiai kviečiami į koralą. Ten jie randa užrašą, prašantį eiti per papildomą laidą. Kabelis veda juos į didžiulę griovį, kur, nustebę, jie mato povandeninį laivą. Jame jie susipažįsta su jo šeimininku ir jo globėju, kapitonu Nemo, Indijos princu Dakkaru, kuris visą savo gyvenimą kovojo už tėvynės nepriklausomybę. Jis, jau šešiasdešimties metų vyras, palaidojęs visus savo bendražygius, yra arti mirties. Nemo dovanoja naujiems draugams karstą su brangakmeniais ir perspėja, kad išsiveržus ugnikalniui sala (tokia yra jos struktūra) sprogs. Jis miršta, naujakuriai apverčia valties liukus ir nuleidžia jį po vandeniu. Jie visą dieną nenuilstamai stato naują laivą. Tačiau jie neturi laiko to baigti. Visas gyvenimas žūva per sprogimą saloje, iš kurios liko tik nedidelis rifas vandenyne. Gyventojai, nakvoję palapinėje ant kranto, oro banga išmeta į jūrą. Visi jie, išskyrus Jupe, lieka gyvi. Daugiau nei dešimt dienų jie sėdėjo ant rifo, beveik mirė iš bado ir nebesitikėjo nieko. Staiga jie pamato laivą. Tai yra Duncan. Jis gelbsti visus. Kaip vėliau paaiškėja, kapitonas Nemo, kol robotas vis dar buvo nepažeistas, plūduriavo ant jo prie Taboro ir paliko užrašą gelbėtojams.
Grįžę į Ameriką dėl papuošalų, kuriuos padovanojo kapitonas Nemo, draugai nusiperka didelį žemės gabalą ir gyvena jame taip, kaip gyveno Linkolno saloje.